EDTA-Fe提高盐碱胁迫下大豆DNA损伤修复的作用机制

申报人:孙秀茹 申报日期:2024-06-29

基本情况

2024
EDTA-Fe提高盐碱胁迫下大豆DNA损伤修复的作用机制 盲选
创新训练项目
农学
植物生产类
学生自主选题
一年期
“以种适地”是关系我国粮食安全的重大战略和提高我国大豆产量的重要途径。本项目的前期研究基础表明,叶面喷施铁肥可显著提高盐碱胁迫下大豆植株的耐性,但其作用机制,目前尚不清楚。本研究以耐盐碱性不同的大豆品种为试验材料,分析EDTA-Fe处理对大豆DNA损伤修复的影响及其作用机制,明确EDTA-Fe处理提高大豆品种耐盐碱能力和产量的普适性,为耐盐碱品种选育、大豆耐盐碱高产栽培技术措施开发提供基础。

1.黑龙江八一农垦大学学成人才引进项目,XYB202007,镉胁迫下miRNA调控MMR基因对拟南芥生长调控研究,2020/12/01-2023/12/0120万元,主持人;

2.黑龙江省博士后面上项目,LBH-Z21196,盐碱胁迫下DNA甲基化调控大豆植株生长的作用机制研究,2021/12/1-2023,12/15万元,主持人;

3.黑龙江省自然科学基金项目,LH2023C078,外源褪黑素调控盐碱胁迫下大豆光合碳代谢的作用机制研,2023/06/01-2026/06/0110万元,主持人;

4.国家重点研发计划“主要作物丰产增效科技创新工程”专项,东北耐盐碱大豆耐盐碱高产生育调控键技术,2023YFD2300103-032023/11/1-2027/11/1,100万元,主持人。

5.横向课题,和平牧场玉米、大豆高产栽培技术,2021/1/1-2022/1/1,15万元,主持人。

本项目的指导教师拥有丰富的科研经验和深厚的专业知识。在项目的试验思路和试验设计方面提供了宝贵的指导并在试验的关键节点提供战略性建议。同时,为本项目提供了必要的实验材料和设备支持,保证了试验的顺利开展,此外,还协助团队成员进行数据分析和结果解释为团队成员提供撰写学术论文和申请专利的指导,极大地促进项目成果的转化。

国家级

项目成员

序号 学生 所属学院 专业 年级 项目中的分工 成员类型
孙秀茹 农学院 农学(创新人才班) 2022 整体统筹规划
龚薪茹 农学院 种子科学与工程 2022 数据处理与分析
赵婧宇 农学院 农学(创新人才班) 2023 报告撰写与实验操作
冯婧 农学院 农学 2023 数据处理与分析

指导教师

序号 教师姓名 所属学院 是否企业导师 教师类型
赵强 农学院

立项依据

2023年中央一号文件指出,持续推动由主要治理盐碱地适应作物向更多选育耐盐碱植物适应盐碱地转变以种适地,在近年来被广泛认可,这也将是黑龙江省苏打盐碱地研究利用的主要趋势。因此,解析植物的盐碱胁迫响应机制、筛选耐盐碱作物品种、开发作物耐盐碱耕作措施成为了实现盐碱地综合利用目标的重要措施。

盐碱胁迫会造成植株造成多种类型的损伤,包括叶面积减少、光能吸收降低、光合器官受损、光合产物分配异常,最终导致植物的生长和产量的下降。盐碱胁迫造成的活性氧积累能够显著的导致DNA的损伤增加。外源补充铁肥可以促进大豆植株的营养生长和生殖生长,也是大豆栽培中重要的农艺措施。本课题组的前期研究结果表明,叶面喷施铁肥处理均能够显著的提高大豆植株的盐碱胁迫耐受性DNA损伤修复能力,但其作用机制,目前尚不明确。

综上所述,本项目以保障国家粮食安全的需求为指引,针对我国大豆产能提升和盐碱地开发利用的重大需求,从大豆耐盐碱性状改良和耐盐碱耕作措施开发背后的科学问题出发,在前期明确铁肥可显著增强大豆植株盐碱耐性的基础上,深入研究EDTA-Fe提高盐碱胁迫下大豆植株DNA损伤修复能力的作用机制,为耐盐碱大豆品种选育和耐盐碱大豆耕作措施开发提供理论依据,对于保障我国粮食安全具有现实意义。


本项目以课题组前期筛选的耐盐碱能力不同的两个大豆品种(耐盐碱大豆品种合丰
55和盐碱敏感大豆品种合农95)为试验材料,拟研究:

1EDTA-Fe对大豆品种盐碱胁迫耐受能力的影响

分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株生长表型、生物量积累、活性氧代谢和分布、抗氧化防御、渗透调节和细胞膜损伤的影响,明确EDTA-Fe处理对大豆品种耐盐碱能力的影响。

2EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆DNA损伤的影响

分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株叶片和根系中细胞核DNA多态性的影响;分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株叶片叶绿体DNA多态性的影响;利用Cold-PCR技术,分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株中DNA损伤标志基因及信号传感器关键基因稳定性的影响。

3EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆DNA损伤修复能力的影响

分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株DNA损伤修复相关基因(包括MLH1MSH2MSH6BRCA1MAD2KU70MRE11RAD51)和细胞周期阻滞变化和细胞周期相关基因表达水平(包括Histone H4E2FaATMATRCDKA;1CYCB1;1CYCB1;2CYCD4;1SOG1WEE1)的影响。

4)大豆叶面喷施EDTA-Fe处理抗盐碱栽培调控技术的应用研究

在盐碱地(pH9.0)开展田间试验,以不同25个不同大豆品种为试验材料,通过叶面喷施EDTA-Fe处理,分析叶面增施铁肥对盐碱胁迫下大豆植株抗性和产量形成的影响,分析EDTA-Fe处理提高大豆品种耐盐碱能力和产量的普适性,为大豆耐盐碱高产栽培技术措施开发提供基础。

1.盐碱胁迫引起的DNA损伤

盐碱环境中存在的高浓度中性盐(NaClNa2SO4)和碱性盐(NaHCO3Na2CO3)能够对植物造成氧化胁迫、渗透胁迫、营养胁迫、离子毒害、高pH值胁迫等,抑制植物的生长,甚至导致死亡[1-3]。盐碱胁迫对植物最常见的影响包括抑制种子的萌发、降低植株生物量、导致叶片枯黄衰亡、籽粒产量和品质下降等[1-4]

活性氧(Reactive oxygen speciesROS)是植物有氧代谢的副产物,但也是参与调控植物生长发育及各种胁迫反应的重要信号分子。盐碱等非生物胁迫能够诱导植物叶绿体、线粒体、质膜、过氧化物酶体和内质网等细胞器内产生大量ROS累积,引起氧化应激反应。过量的ROS会破坏DNA碳水化合物基团、嘌呤、嘧啶碱基和磷酸二酯键的结构,导致各种类型的DNA损伤,包括染色体断裂、链间和链内交联以及单碱基突变[5]ROS诱导细胞核或线粒体DNA氧化损伤的产物为8-羟基-2-脱氧鸟嘌呤(8-OH-dG)[6],而8-羟基鸟苷(8-OHG)负责RNA的氧化修饰[7]8-OH-dGDNA氧化损伤的关键生物标志物。生物医学研究表明,8-OH-dG与突变和癌基因表达有关[8]8-OH-dG可抑制mRNA表达,降低编码蛋白水平。另一种常见的DNA氧化损伤是无尿嘧啶/无嘧啶(AP或碱性)位点出现[9]AP位点可抑制拓扑异构酶活性、DNA复制和转录等功能,从而导致细胞癌变。DNA损伤可以改变生物体的遗传信息,引起细胞毒性或遗传毒性。各种研究表明,DNA氧化损伤可诱导单个细胞的程序性死亡、植物生长抑制或死亡、加速衰老以及植物、细菌或动物的癌症[10]

多项研究表明,提高植物抗氧化防御能力可以有效提高植物的非生物抗逆性。DNA损伤修复(DDR)是植物另一种重要的氧化损伤修复机制。通常,ROS诱导的DNA损伤主要通过碱基切除修复(BER)和核苷酸切除修复(NER)进行修复。DNA错配修复(MMR)、非同源末端连接(NHEJ)和同源重组(HR)也可能参与ROS诱导的DNA损伤的修复,这取决于DNA氧化损伤的类型和结构[11]。各种传感器对DNA损伤的识别是DDR的第一步。细胞周期检查点可以识别DNA损伤信号,然后抑制或阻止细胞周期进程,为DDR提供足够的时间,随后,不同的DNA修复酶被激活以进行DDR

2. DNA损伤修复机制

DNA损伤信号能够被DNA损伤信号感受器,包括MutS单链结合蛋白RPA Replication protein A)复合体和MRNMRE11-RAD50-NBS1)复合体,识别并传递,从而激活ATM/ ATR激酶,进而调控细胞周期阻滞、细胞内复制、细胞凋亡和DNA损伤修复等生物进程[12]。其中,由DNA MMR家族构成的MutS复合体(包括MutSαMutSβMutSγ)是Cd胁迫引起的DNA损伤信号的主要传感器[13]。其中MutSαMSH2MSH6蛋白构成)和MutSγMSH2MSH7蛋白构成)主要负责识别DNA序列中1-2个碱基错配,而MutSβMSH2MSH3蛋白构成)主要识别由2-12个碱基错配修复引起的插入/缺失环[14]。当DNA错配信息被识别后,MutLαMLH1PSM1蛋白构成被招募,并与结合在DNA链上的MutSα /β /γ 形成临时复合体,并通过PCNARFC信号通路启动DNA MMR反应;同时MutLα- MutSα复合体还能够通过ATM/ ATR信号途径启动细胞周期检验点,调控细胞周期相关基因表达和细胞周期进程[15]

DNA损伤信号引起的细胞周期阻滞,为DNA损伤的修复提供充足的时间,对维护生物体遗传信息的高保真性具有重要意义。另有研究表明,MutSα复合体中的MSH2可直接向ATR传递损伤信号,激活ATR-ATRIP途径[16]MSH2也可以招募DNA修复蛋白和MutLα复合体,并将损伤信号传递并激活ATM;活化后的ATM/ATR激活细胞周期检验点,并通过一系列的信号转导最终激活DNA损伤修复反应。

3.铁在植株生长中的作用

铁元素对植株生长具有极其重要的作用,是植物正常生长和发育不可或缺的微量元素之一。铁元素的缺乏会导致植物出现一系列生长和发育障碍[17]。例如,缺铁会导致叶片出现黄化现象,影响叶片的光合作用和物质生产能力;缺铁还会影响植物根系的发育,导致根系发育不良、生长缓慢等问题;此外,缺铁还会影响植物的开花和结实,导致植物生殖能力下降。

铁是叶绿素合成所必需的微量元素之一。叶绿素是植物进行光合作用的主要色素,负责捕获光能并将其转化为化学能,为植物提供生长所需的能量和物质[18]。铁是多种酶和蛋白的组成部分,参与植物的呼吸作用,如细胞色素氧化酶等。这些酶在呼吸作用中发挥着重要作用,参与能量的产生和转换,为植物的生长和代谢提供必要的能量支持[19]。铁是固氮酶的重要组成成分,对于植物的氮代谢和固氮作用具有重要意义。固氮酶能够将空气中的氮气转化为植物可吸收的氨态氮,为植物提供氮源,促进植物的生长和发育。铁元素还参与植物抗氧化防御系统的构建和运作。铁元素通过参与抗氧化酶的合成和活性调节,帮助植物清除ROS,减轻氧化胁迫对植物的伤害[20]

与传统的铁肥相比较,EDTA-Fe具有良好的水溶性,性质稳定,可耐高温,不易被氧化可用作微量元素肥料,为植物提供稳定的铁源,有助于预防和解决植物因缺铁而产生的生长问题。同时,EDTA-Fe的吸收率高,生物医学研究表明,其吸收率为硫酸亚铁的23[21]。但EDTA-Fe在大豆盐碱胁迫响应中的作用及大豆耐盐碱耕作措施中的应用,目前研究尚少。

主要参考文献:

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[6] Daniele, L.B., Gianfranco, T., Francesco, T. & Angela, S. (2010) Traffic air pollution and oxidatively generated DNA damage: can urinary 8-oxo-7,8-dihydro-2-deoxiguanosine be considered a good biomarker? A meta-analysis. Biomarkers: Biochemical Indicators of Exposure, Response, and Susceptibility to Chemicals, 15(6), 538–545.

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[11] D'Errico, M., Parlanti, E., Teson, M., De Jesus, B.M.B., Degan, P., Calcagnile, A. et al. (2014) New functions of XPC in the protection of human skin cells from oxidative damage. EMBO Journal, 25, 4305–4315.

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[17] 梁志君.锌铁胁迫对水稻生长的影响及籽粒累积锌铁差异的研究[D].华中农业大学,2016.

[18] 贾凤芹.喷施铁肥对葡萄、桃叶片光合特性和果实品质的影响[D].河南科技学院,2023.

[19] 侍朋宝.铁对酿酒葡萄果实风味物质及类黄酮合成相关基因表达的影响[D].西北农林科技大学,2017.

[20] 丁申.铁和谷胱甘肽对杨树积累镉的生理与分子调控机制研究[D].西北农林科技大学,2019.

[21] 李思慧.EDTA-Fe插层水滑石UV-Fenton降解偶氮胭脂红B的研究[D].湘潭大学,2016.

目前,缺少关于盐碱胁迫下大豆植株DNA损伤修复能力的作用机制的相关研究报道。本研究通过对DNA损伤情况及DNA损伤修复相关基因表达水平等关键指标的检测分析,从而揭示EDTA-Fe处理调控盐碱胁迫下大豆植株DNA损伤修复能力的作用机制

与传统的铁肥相比,EDTA-Fe具有良好的水溶性,性质稳定,可耐高温,不易被氧化可用作微量元素肥料,为植物提供稳定的铁源,有助于预防和解决植物因缺铁而产生的生长问题。同时研究表明EDTA-Fe的吸收率高。但EDTA-Fe在大豆盐碱胁迫响应中的作用及大豆耐盐碱耕作措施中的应用,目前研究尚少。

技术路线:

拟解决的问题:

1)揭示EDTA-Fe处理调控盐碱胁迫下大豆植株DNA损伤修复能力的作用机制;

2)明确EDTA-Fe处理提高大豆品种耐盐碱能力和产量的普适性。

预期成果:

1.参加省级以上学科竞赛2次,并获二等奖以上奖励1项

2.发表省级以上研究论文1篇

2024.6-2024.9:分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下大豆植株生长表型、DNA损伤、细胞周期调控的影响,参加学科竞赛1次。

2024.9-2024.10:分析EDTA-Fe处理对盐碱胁迫下不同大豆植株产量性状的影响;

2024.10-2025.6:参加学科竞赛1次,完成论文的发表和结题报告。

本项目依托单位具有国家级和省级重点实验室,具备本项目进行实验研究所需要的各种仪器及设备。本单位具有3个盐碱地研究试验基地,总面积超过500亩。项目申请人所在团队的科研实验室具有露点水势仪(PPRO)、荧光显微镜(RVL2-K,ECHO)、植物激光三维表型仪Planteye F500(Phenospex,Swiss)、光合测定仪LI-6800(LI-COR Inc., Lincoln)、便携式荧光测量系统(PAM-2500 chlorophyll fluorometer,Heinz Walz Gmb H)、多功能酶标仪(Varioskan Flash,Thermo Fisher)、流式细胞仪(CytoFLEX,Beckman Coulter)、PCR扩增仪(T100,Bio-Rad)、荧光定量PCR扩增仪(CFX-96,Bio-Rad)、(XS105DU,Mettlertoledo)、水平槽电泳仪(DYCP-31DN,六一)、垂直板电泳仪(DYCZ-24DH,六一)、核酸测定仪(Nandrop 2000,Thermo Fisher)、凝胶成像分析系统及分析软件(ChemiDoc,Bio-Rad)、全自动化学分析仪(Smartchem200,ALLIANCE)、步入式人工气候室、无菌操作室等。以上实验条件能够保障项目的顺利实施。

经费预算

开支科目 预算经费(元) 主要用途 阶段下达经费计划(元)
前半阶段 后半阶段
预算经费总额 10000.00 购买试剂耗材 6000.00 4000.00
1. 业务费 0.00 0.00 0.00
(1)计算、分析、测试费 0.00 0.00 0.00
(2)能源动力费 0.00 0.00 0.00
(3)会议、差旅费 0.00 0.00 0.00
(4)文献检索费 0.00 0.00 0.00
(5)论文出版费 0.00 0.00 0.00
2. 仪器设备购置费 0.00 0.00 0.00
3. 实验装置试制费 0.00 0.00 0.00
4. 材料费 10000.00 购买试剂耗材、申请专利 6000.00 4000.00

项目附件

  • EDTA-Fe提高盐碱胁迫下大豆DNA损伤修复的作用机制-笔杆论文检测报告-20240627.zip
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结束